La prévention du donovanose se fait par l'utilisation de préservatifs dans tout type de contact intime. Il est important de vérifier si la plaie est protégée avec le préservatif, car si la plaie exposée entre en contact avec le partenaire, le donovanose risque fort d'être transmis. Éviter le contact intime lorsqu'il y a des symptômes de la maladie est primordial pour la prévention du donovanose.